РНПЦ дзіцячай хірургіі ажыццяўляе ўкараненне вынікаў сваёй навуковай і інавацыйнай дзейнасці ва ўстановы адукацыі Рэспублікі Беларусь.
Беларускі дзяржаўны медыцынскі ўніверсітэт і Беларуская медыцынская акадэмія паслядыпломнай адукацыі з’яўляюцца асноўнымі арганізацыямі, у навучальны працэс якіх укараняюцца вынікі даследаванняў РНПЦ дзіцячай хірургіі.